Loimaalla toisen asteen koulutusta, aikuisopiskelua sekä työelämän täydennyskoulutusta tarjoaa Novida ammattiopisto ja lukio -oppilaitos. Lounais-Suomen koulutuskuntayhtymän ylläpitämän Novidan ammatillisen koulutuksen toimipaikat ovat Liedossa, Loimaalla ja Uudessakaupungissa. Lukio toimii Loimaalla. Lisäksi kuntayhtymällä on oma oppisopimustoimisto.

Loimaan evankelisessa kansanopistossa (Leko) voi suorittaa muun muassa peruskoulun jälkeisen kymppiluokan, ammatillista täydennyskoulutusta sekä erilaisia lyhytkursseja.